灌注治疗临床上常指膀胱灌注治疗，是将化学药物或免疫抑制剂直接注入膀胱内的治疗措施，从而起到预防尿路上皮癌术后膀胱内肿瘤复发和治疗慢性膀胱炎、间接性膀胱炎、膀胱大出血等疾病的作用。
灌注治疗操作时患者取仰卧位，待会阴及尿道口充分消毒后，将双腔导管缓缓插入尿道，排尽膀胱内残余尿量后，将50ml灌注液缓缓注入患者膀胱内，最后再注入5-10ml生理盐水或空气，以确保将导管内残留的灌注液全部注入膀胱内，再缓慢拔出导管。
灌注结束后患者要卧床休息，分别取左侧卧位、右侧卧位、仰卧位、俯卧位各10-30分钟，使药物与膀胱各壁黏膜组织充分接触，保证药效。达到所要求的保留时间后可自主排尽药液，排尽药液后要多饮水，加速尿液生成，使排出的尿液内药物浓度降低，减少药物对膀胱及尿道黏膜的刺激。
患者还应注意在灌注药物前应排空膀胱，灌注前4个小时及灌注液排出前，尽量控制不饮水或少饮水。灌注药物时一定要注意药物的过敏反应，如果进行卡介苗的灌注，只有经过卡介苗皮试阴性者才可使用。若患者存在明显尿路感染，也要避免灌注治疗。